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生物信息特训班-R语言部分、转录组

bigegpt 2024-10-05 13:42 3 浏览


2021年至今,“科研日精进课堂”已推出线上课程20+,培训学员1500+,非常感谢小伙伴们的支持,90度鞠躬!暑期即将来临,我们计划充分利用这段时间,举办一次生物信息强基训练营!


前期在授课中老师发现较多学员的生信基础比较薄弱,学习起来吃力 ,所以这个“3+5+5”共13天的课程应运而生:基础班3天从最最基础的linux操作、测序原理开始讲起,让0基础的学员入门生物信息,收费1元!特训班先用5天打开R语言世界大门,系统学习这门统计绘图必备课程。最后学以致用,在老师带领下,再用5天时间完成一个完整的转录组项目的分析与可视化作图。


韶华易逝,莫负流年,七月赶紧来“科研日精进课堂”完成你的生信蜕变之旅吧!

主办平台


科研日精进课堂


授课形式


直播课+永久答疑+无限回放


3+5+5课程,自由组合学习


提供高性能服务器配合练习


课程安排






生物信息基础班(07.07-07.09)
限时拼团价1元!!!

第1天(07.07)

第1天 Linux基础(上)

1.Linux系统是什么?

2.怎么在个人电脑或服务器上安装Linux系统

3.登录服务器和上传下载文件

4.怎么管理文件和目录

5.环境变量是什么,应该怎么配置?

6.什么是用户权限,怎么设定权限

7.怎么进行进程管理

8.Vim编辑器怎么用

14:00-17:00
第2天(07.08)

第2天 Linux基础(下)

1.30个常用的Linux命令

3.如何安装生物软件?不同软件的安装方式(编译好的和没编译的)

4.bioconda是什么?到底有什么用?

5.常用的三款生物软件:blast、bowtie与samtools的使用

6.怎么让程序在后台一直运行

7.什么是虚拟环境?都有什么优点?

8.Singularity该如何使用

14:00-17:00
第3天(07.09)

第3天 测序原理与分析基础

1.什么是测序?每种测序仪的原理是什么?

2.建库到底是什么?怎样建一个测序的文库

3.测序到底有几种,都能干什么?

4.测序的格式是什么,怎么看里面的信息

5.公共数据库测序数据怎么查找,怎么下载

14:00-
17:0
0

生物信息特训班-R语言部分(07.11-07.15)

第4天
(07.11)

第1天 R语言基础

1.如何搭建R语言环境

2.几类R包的安装方式

3.如何成功读取自己的数据而不报错

19:30-
21:00
第5天
(07.12)

第2天 R语言变量类型与控制结构

1.向量、矩阵、数据框、列表

2.字符型、数值型、整数型、复合型、逻辑型数据

3.如何用for循环批量处理大量数据

4.如何编写可重复使用的绘图脚本

19:30-
21:00


第6天

(07.13)

第3天 R语言统计分析与数据清洗

1.数据检验、相关性分析与回归分析

2.宽数据与长数据的转换

3.如何将数据转变为可以绘图的数据

19:30-

21:00

第7天

(07.14)

第4天 R语言绘图基础

1.R绘图基础与ggplot2绘图

2.条形图、折线图、散点图

3.直方图、饼图、箱线图、小提琴图

19:30-

21:00

第8天

(07.15)

第5天 R学术期刊绘图

1.曼哈顿图、火山图、韦恩图、Upset图

2.热图、相关性系数图、词云图、圈图

3.按照学术期刊发表标准组图并修改

19:30-

21:00


生物信息特训班-转录组部分(07.18-07.22)

第9天
(07.18)

第1天 转录组分析基础

1.转录组分析中的名词与要点

2.无参转录组与有参转录组的分析方法

3.如何评价测得的转录组数据

4.怎样对转录组测序数据进行过滤

19:30-
21:00
第10天
(07.19)

第2天 数据比对和组装

1.怎样对无参转录组进行组装

2.如何选择合适的参考基因组并进行分析

3.计算基因表达量的方式

4.怎么进行差异基因分析

5.画差异基因的热图、火山图

19:30-
21:00


第11天

(07.20)

第3天 基因功能注释

1.NR、Swissprot、KOG/COG、Pfam注释

2.GO功能注释及富集分析

3.KEGG功能注释及富集分析

4.如何把基因热图展现在通路上

19:30-

21:00

第12天

(07.21)

第4天 转录组个性化分析

1.如何进行进行转录因子分析

2.转录组的突变位点分析

3.IGV基因组可视化

4.基因功能分析利器Mapman

19:30-

21:00

第13天

(07.22)

第5天 基因网络分析及转录组文章解读

1.蛋白互作网络分析

2.WGCNA基因共表达网络

3.Cytoscape网络图的绘制

4.如何使用转录组数据发表文章(纯生信或湿实验+生信)

19:30-

21:00


课程插图



课程介绍




平台

"科研日精进课堂"是一个广大科研人员学习提高生物信息分析能力,获取最新生信技巧和资讯的活跃平台。



讲师

小宇老师


TOP10高校博士,2021年担任“科研日精进课堂主讲老师,目前共讲授15门生信课程,学员1000+ 。擅长R、Perl、Python等编程语言和多组学大数据分析,拥有8年生信分析经验,4年生信培训经验,编写17款多组学分析软件(著作权已下证),主导开发了无代码生信分析云平台“鼠小弟”,用户超7000人。



学习

1. PC 端:学员可以在PC端进行学习,方法是在网站"www.keyandaydayup.com"中点击视频课。

2. 微信端:在公众号“科研日精进课堂”点击视频课-直播课。

3. 课程在两年内均可以无限次回放。



答疑

1. 课程期间,每天答疑,学员可以共享自己的屏幕并语音互动,讲师帮助解决学员遇到的问题。

2. 课程结束,学员可以继续在答疑群提问,获得终生答疑。我们坚持,报名一次,服务终身,保证让您掌握所有的知识。



缴费

1. 推荐直接线上购买,可任意选择课程购买,两门提高课组合购买享优惠;

2. 若需对公转账,可先拍下课程,然后课程助理会与您沟通,我们会在单位转账完成后退还费用。



发票

可提供培训、会议通知或合同等,发票可开会议注册费、测试分析费等内容。



培训费用



价格(元)拼团价
基础班
49
1
特训班-R语言部分25002400
特训班-转录组部分25002400
特训班两门课组合购4000-



6月30日前报名享早鸟优惠200元,优惠券直接在报名页面领取,可与拼团叠加。尽量早报名哦!




报名方式

1. 扫描二维码,线上报名

2. 收到报名信息,我们会电话或微信与您沟通
3. 课程助理会根据您要求提供合同、会议通知(邀请函)、发票等,发票明细可开培训费、会议费、技术服务费、测序分析费等。

报名入口


基础班


R语言


转录组

R语言+转录组


单细胞


客服微信


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