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原创 小果 生信果

小果这里简单阐述下普通用户如何使用Rstudio

背景：ubuntu 20.04服务器上安装好Rstudio

Rstudio版本：2021版本，R版本为4.2.1

Rstudio 哪里登录以及如何登录

在任意浏览器输入安装Rstudio服务器的IP和端口

端口默认是8787，（如需变更，需要配置对应的路由器，或者直接服务端配置即可，细节这里不阐述）

http://IP:端口/auth-sign-in?appUri=%2F

RStudio 登录后的界面是什么样子？

如图：

如何上传数据

图中圈出的 文件files--上传upload,然后弹出 upload files 就可以上传了

如何查看图片

如果是输出的pdf文档，可以直接点击，默认会在网页的新窗口弹出

如何下载数据

需要下载的文件前面打对勾，然后Files--More--export，弹出框--选择download即可。

不知道下载到哪里，可以通过查看网页浏览器下载记录即可。一般是保存到默认下载位置。

如何查看文档

如何查看txt文档或对应的R代码文档：

点击对应的文档，然后在左上方会展示对应的结果

常见问题：

Q:经常莫名其妙的报错：

检查所有的命令，是否输入完整，以及输入的字符都是英文格式， 以及引号是否正常，括号是否是英文格式等等，细节要检查到位。

Q:读取文件，提示找不到

getwd() #查看当前路径，有时候运行保存，路径需要和数据的位置一致才行。

setwd(“”)#更改路径，需要加引号

Q: 程序在运行中，过了一会自动退出了

Rstudio 默认1小时无任何操作自动断开，但后台还在运行。

如需取消自动退出，需要联系管理员，配置如下：

sudo vim /etc/rstudio/rserver.conf

添加

auth-timeout-minutes=0 #取消自动退出

auth-stay-signed-in-days=30 #30天内默认登录

Q：上传数据然后一直转圈圈传不上

一般是网络问题，数据太大的话建议使用第三方的FTP工具来进行，比如Filezilla等也支持断点续传。

Q：我想切换R的其他版本，不知道怎么操作？

Ubuntu 20.04下的Rstudio 一般不推荐切换，比较麻烦。特别是多人使用。无法做到用户1使用R3.6版本，用户2使用R4.2版本。

需要管理员权限，且在命令行界面操作。

推荐的解决办法：命令行模式下调用不同的R版本，比如putty或xshell登录后操作。

Windows下可以直接选择对应的安装R的路径即可。