百度360必应搜狗淘宝本站头条
当前位置:网站首页 > 热门文章 > 正文

ggstatsplot-专为学术绘图而生(一)

bigegpt 2024-09-08 11:36 4 浏览

美图神器ggstatsplot-专为学术论文而生

在CRAN(comprehensive R Achive Netwokrk)中已有13000多个R包了
简单讲ggstatsplot能够提供更为丰富信息的包,其实就是画出高质量的图
不需要我们花费过多的精力去调整绘图细节;举个例子,一般的探索性数据分过程析包括数据可视化与数据统计两个部分,而ggstatsplot正是达到两者结合的目的

举例说明

组间比较-ggbetweenstats

1library(ggstatsplot)
2library(ggplot2)

p代表参数检验,np代表非参数
mpaa是分类变量,y是数值型变量

 1head(movies_long)
 2## # A tibble: 6 x 8
 3##   title                        year length budget rating  votes mpaa  genre
 4##   <chr>                       <int>  <int>  <dbl>  <dbl>  <int> <fct> <fct>
 5## 1 Shawshank Redemption, The    1994    142     25    9.1 149494 R     Drama
 6## 2 Lord of the Rings: The Ret~  2003    251     94    9   103631 PG-13 Acti~
 7## 3 Lord of the Rings: The Fel~  2001    208     93    8.8 157608 PG-13 Acti~
 8## 4 Lord of the Rings: The Two~  2002    223     94    8.8 114797 PG-13 Acti~
 9## 5 Pulp Fiction                 1994    168      8    8.8 132745 R     Drama
10## 6 Schindler's List             1993    195     25    8.8  97667 R     Drama
11ggbetweenstats(
12  data = movies_long,
13  x = mpaa, # > 2 groups
14  y = rating,
15  type = "p", # default
16  messages = FALSE
17)


image.png


默认参数绘图

1ggbetweenstats(
2  data = movies_long,
3  x = mpaa,
4  y = rating
5)


image.png


配对比较
pairwise.display参数控制曾现的比较,ns无意义,all,所有,s有意义的

 1ggbetweenstats(
 2  data = movies_long,
 3  x = mpaa,
 4  y = rating,
 5  type = "np",
 6  mean.ci = TRUE,
 7  pairwise.comparisons = TRUE,
 8  pairwise.display = "s",
 9  p.adjust.method = "fdr",
10  messages = FALSE
11)


image.png


调整颜色,主题,可信区间调整,突出值标记
confi.level:可信区间调整,ggtheme主题,pallete:颜色调用
outlier:超出界限标记

 1ggbetweenstats(
 2  data = movies_long,
 3  x = mpaa,
 4  y = rating,
 5  type = "r",
 6  conf.level = 0.99,
 7  pairwise.comparisons = TRUE,
 8  pairwise.annotation = "p", 
 9  outlier.tagging = TRUE,
10  outlier.label = title,
11  outlier.coef = 2,
12  ggtheme = hrbrthemes::theme_ipsum_tw(),
13  palette = "Darjeeling2",
14  package = "wesanderson",
15  messages = FALSE
16)


image.png


ggwithinstats组内比较

图还是非常美观,就不去细讲每个参数了,需要时调用即可,这也是作者的意图

 1ggwithinstats(
 2  data = WRS2::WineTasting,
 3  x = Wine, # > 2 groups
 4  y = Taste,
 5  pairwise.comparisons = TRUE,
 6  pairwise.annotation = "p",
 7  ggtheme = hrbrthemes::theme_ipsum_tw(),
 8  ggstatsplot.layer = FALSE,
 9  messages = FALSE
10)


image.png


相关性图-ggscatterstats

代码简介,细节丰富

1ggscatterstats(
2  data = movies_long,
3  x = budget,
4  y = rating,
5  type = "p", # default #<<<
6  conf.level = 0.99,
7  marginal=F,
8  messages = TRUE
9)


image.png


其实还可以画很多其它的图,颜值都非常高,这里不再过多介绍,真正做到一图胜千言

总结一下这个包的局限性:

虽然图的信息量大,但有时比如presentation,时间不够,图信息过多反而不利于简明扼要的传达信息

另外就是计算的统计量比较单一

参考资料:[官方文档]档]https://indrajeetpatil.github.io/ggstatsplot_slides/slides/ggstatsplot_presentation.html#35

相关推荐

Redis集群对比:主从复制、哨兵模式、Cluster一文看懂所有优缺点

在分布式系统中,Redis作为高性能的内存数据库,其集群方案的选择直接影响到系统的稳定性、可用性和扩展性。本文将全面对比Redis的三种主流集群方案:主从复制、哨兵模式和Cluster模式,帮助开发者...

redis的主从复制,读写分离,主从切换

当数据量变得庞大的时候,读写分离还是很有必要的。同时避免一个redis服务宕机,导致应用宕机的情况,我们启用sentinel(哨兵)服务,实现主从切换的功能。redis提供了一个master,多个sl...

# Redis 入门到精通(九)-- 主从复制(3)

#Redis入门到精通(九)--主从复制(3)##一、redis主从复制-常见问题(1)###1、伴随着redis系统的运行,master的数据量会越来越大,一旦master重启...

redis - 主从复制(Redis主从复制时序图)

1引言在上一篇文章中,我们了解了Redis两种不同的持久化方式,Redis服务器通过持久化,把Redis内存中持久化到硬盘当中,当Redis宕机时,我们重启Redis服务器时,可以由RDB文件或AO...

# Redis 入门到精通(九)-- 主从复制(2)

#Redis入门到精通(九)--主从复制(2)##一、redis主从复制--数据同步阶段注意事项###1、数据同步阶段master说明1)如果master数据量巨大,数据同步阶段应...

Redis主从复制(redis主从复制主节点挂了)

介绍Redis有两种不同的持久化方式,Redis服务器通过持久化,把Redis内存中持久化到硬盘当中,当Redis宕机时,我们重启Redis服务器时,可以由RDB文件或AOF文件恢复内存中的数据。不过...

深入解析 Redis 集群的主从复制实现方式

在互联网大厂的后端开发领域,Redis作为一款高性能的内存数据库,被广泛应用于缓存、消息队列等场景。而Redis集群中的主从复制机制,更是保障数据安全、实现读写分离以及提升系统性能的关键所在。今...

Redis主从架构详解(redis主从架构高可用如何实现)

Redis主从架构搭建Redis主节点配置创建主节点目录(/opt/redis-master),复制redis.conf到该目录下,redis.conf配置项修改#后台启动daemonizeyes...

抖音“四大包塘战神”:承包了全网的快乐

在抖音钓鱼垂类领域,"包塘战神"军团正掀起一场黑色幽默风暴。空军华、大表坑、李赔光、透心良四位创作者,以承包鱼塘为舞台,用连续翻车的钓鱼直播构筑起流量奇观。当钓鱼佬在抖音集体转型喜剧人...

ORACLE 11G RAC 安装-通过VM配置共享磁盘

简介:在自己的电脑上通过VM软件搭建Oracle11GRAC,通过修改VM的参数文件来实现磁盘共享!目标:搭建RAC环境实现:使用VMwareWorkstation8.0.0+ORACLE...

Linux操作系统安全配置(linux系统安全配置包括)

一、服务相关命令systemctlenable服务名#开机自启动systemctldisable服务名#禁用开机自启动systemctlstop服务名#停止服务systemctls...

关于Linux性能调优中网络I/O的一些笔记

写在前面和小伙伴分享一些Linux网络优化的笔记,内容很浅,可以用作入门博文内容结合《Linux性能优化》读书笔记整理涉及内容包括常用的优化工具(mii-tool,ethtool,ifconfig,i...

从 Sonatype Nexus Repository Manager 迁移到 Artifactory

1.Nexus1.1下载下载链接:https://help.sonatype.com/repomanager3/product-information/download/download-archiv...

Ubuntu20安装zabbix5.0企业监控系统亲测教程

前言示例主机:zabbix10.0.100.10,将安装在UbuntuServer上教程说明:因使用官方教程无法安装成功,所以本教程与官方教程有所不同安装前提:已安装UbuntuServer2...

Linux内核设计与实现—进程管理(linux内核程序设计)

进程进程就是处于执行期的程序(目标码存放在某种存储介质上)。进并不仅仅局限于一段可执行程序代码(Unix称其为代码段,textsection)。通常进程还要包含其他资源,像打开的文件,挂起的信号,...