R语言绘制桑基图,做好了也可以出大片!
bigegpt 2024-09-27 00:36 5 浏览
背景介绍
什么样的数据可以用桑基图?比如下面的,你可以理解为有大于等于2列的文本标签以及1列统计数值就可以。
如果只有大于两组的文本标签,也是可以的。
桑基图的核心组成部分包括边、流量和节点,这里的边表示流动数据,流量则对应流动数据的确切数值,而节点则代表不同的类别。边的宽度根据流量成比例地呈现,宽度越大,数值也越高。
软件介绍
软件名称:R 4.2.2
教程介绍
1.下面是来自于官网的示例,输入?geom_alluvium即可查看。首先下载和加载该R包
library(ggplot2)
library(ggalluvial)
2.输入?geom_alluvium,就可以查看该函数的功能和参数
3.首先画一个基础的桑基图
ggplot(as.data.frame(Titanic),
# 定义图形的绘制
aes(y = Freq,
axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age,
fill = Survived)) +
geom_alluvium() +
scale_x_discrete(limits = c("Class", "Sex", "Age"))
4.我们继续给每列的不同标签加上方框以及对应的文字
ggplot(as.data.frame(Titanic),
aes(y = Freq,
axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age)) +
#geom_alluvium设置中间的曲线:颜色填充,透明度,曲线类型
geom_alluvium(aes(fill = Class))+
# 设置中间框的格式
geom_stratum()+
# 对中间框上的标签进行设置
geom_text(stat = "stratum",
aes(label = after_stat(stratum)),
size = 5,angle=0,
family = "Arial")+
#自定义X和Y轴上的标签
scale_x_continuous(breaks = 1:3,
labels = c("Class", "Sex", "Age"),
expand = c(0,0))+
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+
# 定义X和Y轴的名称
labs(x = "Group", y = "Frequency")+
# 设置图形主题样式
theme_bw()+
theme(legend.position = "none",
text = element_text(family = "serif",
face = "bold",
size = 14))
5.也可以给加上一行代码coord_flip(),也可以变成下面这样
6.接下来我们对中间的方块进行颜色填充(## 为新添加的内容)
ggplot(as.data.frame(Titanic),
aes(y = Freq,
axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age)) +
#geom_alluvium设置中间的曲线:颜色填充,透明度,曲线类型
geom_alluvium(aes(fill = Class))+
## 设置中间框的格式
geom_stratum(aes(fill = Class))+
## 设置填充的颜色板
scale_fill_brewer(palette = "Set1")+
# 对中间框上的标签进行设置
geom_text(stat = "stratum",
aes(label = after_stat(stratum)),
size = 5,angle=0,
family = "Arial")+
#自定义X和Y轴上的标签
scale_x_continuous(breaks = 1:3,
labels = c("Class", "Sex", "Age"),
expand = c(0,0))+
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+
# 定义X和Y轴的名称
labs(x = "Group", y = "Frequency")+
# 设置图形主题样式
theme_bw()+
theme(legend.position = "none",
text = element_text(family = "serif",
face = "bold",
size = 14))
7.上面我们只填充了第一列的颜色,这样,原本填充的geom_alluvium(aes(fill = Class))以及geom_stratum(aes(fill = Class))进行叠加之后,第一列的颜色就变深了。这样,整个数据能明显看出来数据流是从哪里出来的,流向哪里的。但如果我们将三列,即Class、Sex、Age都进行填充,会是什么效果呢?(## 为新添加的内容)
ggplot(as.data.frame(Titanic),
aes(y = Freq,
axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age)) +
# geom_alluvium设置中间的曲线:颜色填充,透明度,曲线类型
geom_alluvium(aes(fill = Class))+
# 设置中间框的格式
geom_stratum(aes(fill = Class))+
## 设置另外两列
geom_stratum(aes(fill = Sex))+
geom_stratum(aes(fill = Age))+
# 设置填充的颜色板
scale_fill_brewer(palette = "Set1")+
# 对中间框上的标签进行设置
geom_text(stat = "stratum",
aes(label = after_stat(stratum)),
size = 5,angle=0,
family = "Arial")+
#自定义X和Y轴上的标签
scale_x_continuous(breaks = 1:3,
labels = c("Class", "Sex", "Age"),
expand = c(0,0))+
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+
# 定义X和Y轴的名称
labs(x = "Group", y = "Frequency")+
# 设置图形主题样式
theme_bw()+
theme(legend.position = "none",
text = element_text(family = "serif",
face = "bold",
size = 14))
8.填充之后颜色更加丰富,但其实由于颜色太多,图形数据分不清楚主次了,所以还是建议只填充第一列比较好,这样能看出来明显的数据流。你也可以将柱子填充为一种颜色(## 为新添加的内容)。显然,这种效果其实也并不是很好,因为桑基图,其实最好能看清楚,数据是从哪里流向哪里的,如果不能以这个为重点,就不太建议了
ggplot(as.data.frame(Titanic),
aes(y = Freq,
axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age)) +
# geom_alluvium设置中间的曲线:颜色填充,透明度,曲线类型
geom_alluvium(aes(fill = Class))+
## 设置中间框的格式
geom_stratum(fill = "lightblue")+
# 设置填充的颜色板
scale_fill_brewer(palette = "Set1")+
# 对中间框上的标签进行设置
geom_text(stat = "stratum",
aes(label = after_stat(stratum)),
size = 5,angle=0,
family = "Arial")+
#自定义X和Y轴上的标签
scale_x_continuous(breaks = 1:3,
labels = c("Class", "Sex", "Age"),
expand = c(0,0))+
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+
# 定义X和Y轴的名称
labs(x = "Group", y = "Frequency")+
# 设置图形主题样式
theme_bw()+
theme(legend.position = "none",
text = element_text(family = "serif",
face = "bold",
size = 14))
9.另外有一点,就是数据的排列问题,比如第一列,数据大小并没有按照顺序排列;第二列也是
10.那么给加上一行代码decreasing = FALSE就行(## 为新添加的内容),这样,每列的数据都是从上到下,从大到小排列
ggplot(as.data.frame(Titanic),
aes(y = Freq,
axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age)) +
# geom_alluvium设置中间的曲线:颜色填充,透明度,曲线类型
geom_alluvium(aes(fill = Class),
## 降序排列
decreasing = FALSE)+
## 设置中间框的格式
geom_stratum(aes(fill = Class),
## 降序排列
decreasing = FALSE)+
# 设置填充的颜色板
scale_fill_brewer(palette = "Set1")+
# 对中间框上的标签进行设置
geom_text(stat = "stratum",
aes(label = after_stat(stratum)),
size = 5,angle=0,
family = "Arial",
## 降序排列
decreasing = FALSE)+
#自定义X和Y轴上的标签
scale_x_continuous(breaks = 1:3,
labels = c("Class", "Sex", "Age"),
expand = c(0,0))+
scale_y_continuous(expand = c(0,0))+
# 定义X和Y轴的名称
labs(x = "Group", y = "Frequency")+
# 设置图形主题样式
theme_bw()+
theme(legend.position = "none",
text = element_text(family = "serif",
face = "bold",
size = 14))
11.改成decreasing = TRUE则是升序排列,即从上到下,从小到大排列
12.一定要同时升序或降序数据流、中间框、以及框里的文字,要不然就乱了。好了,这样的话基本就可以画出来自己比较满意的桑基图了。
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