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华夫饼图:可视化展示利器(ggplot版本)

写在前面不知何时起，我总是喜欢在推文前面写上写在前面，可能是表达我的一种心境吧。在家里的日子在不断的测试和完善流程，每当我累了的时候，总想去gogle找一些新鲜东西，然后修改，适最后合自己的模子，变成对自己功能强大的样子，慢慢的这种方式变成了习惯。华夫饼干图在本文中，我将展示如何使用ggplot2绘...

小果带你绘制好看的渐变火山图 小果带你绘制好看的渐变火山图片

尔云间一个专门做科研的团队生信果点赞+收藏+关注[送心]火山图大家非常熟悉了，是用来展示差异分析的经典图片。但是近期有小伙伴来问小果，认为以前的火山图有点过时了，想绘制不一样的火山图，想问一下小果这里有没有想法。当然有了[得意]，今天小果就带你绘制不一样的火山图——渐变火山图，赶快跟小果一...

科研绘图——韦恩图 韦恩图怎么做画

韦恩图是用来表现n个集合（n一般小于7）之间共有元素的可视化图，用R绘制韦恩图。构建数据set.seed(20190708)genes<-paste("gene",1:1000,sep="")x<-list(A=sample(gene...

GO/KEGG富集分析泡泡图中为什么基因的数目是小数?

在上次转录组可视化课程中，有位老师看到富集分析泡泡图的图例中的Count存在小数，于是提出了这么一个问题：为什么基因的数目有小数？之前没有注意过这个问题，应该是ggplot2默认的图例生成方式所导致的。看下面这个代码，根据数据不同，产生同样长度的区间，有时会得到小数，有时会得到整数。>seq...

绘制CV折线图 ncl画折线图

尔云间一个专门做科研的团队原创小果生信果我们在得到分组数对应的交叉验证错误结果后，选择最低CV值对应的分组数作为最佳的分组数，对于这个结果我们可以使用折线图展示，效果如下在本次尝试中，小果使用了ggthemr这个配色主题包，上图使用的是flat主题，小云代码注释展示了可用的所有主题，大家可以...

[数据分析与可视化] 数据绘图要点12-图表注释的重要性

数据绘图要点12-图表注释的重要性图表注释是数据可视化的关键组成部分。它可以将枯燥的图形变成一种有趣且富有洞察力的信息传达方式。我们目前在网上看东西的注意力平均不到五秒。因此，如果您无法在五秒钟内吸引某人的注意力，那么您可能已经失去了观众。添加准确的注释可以极大地帮助吸引观众的注意力。使用关键字、形...

通过简单的线性回归理解机器学习的基本原理

在本文中，我将使用一个简单的线性回归模型来解释一些机器学习(ML)的基本原理。线性回归虽然不是机器学习中最强大的模型，但由于容易熟悉并且可解释性好，所以仍然被广泛使用。简单地说，线性回归用于估计连续或分类数据之间的线性关系。我将使用X和y来表示变量。如果你喜欢更具体的东西，可以想象y是销售额，X是广...

用ggplot2绘制森林图 graphpad prism画森林图

医海无涯，AI同舟。关注我们，助力高效科研。要使用ggplot2绘制森林图，您可以按照以下步骤进行操作：1、准备数据您需要准备一些数据来绘制森林图。通常，您需要准备一个数据框，其中每行代表一个样本，每列代表一个分类变量。每个样本的每个分类变量都应该有一个值，用于计算该变量在样本中的占比。例如，以下...

终于找到了，ggplot 中可以逆转坐标轴方向了

用ggplot绘图时，默认的坐标轴是沿着箭头方向数值增大，也就是说x轴向右数值增大，y轴向上数值增大，但是有时候我们希望坐标轴数值逆向增加，也就是说x轴向左数值增大，y轴向下数值增大。图示如下：为达到这样的效果可以使用scale_x_reverse()和scale_y_reverse()函数。示例...

跟着iMeta学做图|ggplot2绘制相关性分析线面组合热图

本文代码已经上传至https://github.com/iMetaScience/iMetaPlot230118corr如果你使用本代码，请引用：ChangchaoLi.2023.Destabilizedmicrobialnetworkswithdistinctperformanc...