绘制CV折线图 ncl画折线图

bigegpt 2024-09-27 00:36 5 浏览

尔云间一个专门做科研的团队

原创小果生信果

我们在得到分组数对应的交叉验证错误结果后，选择最低CV值对应的分组数作为最佳的分组数，对于这个结果我们可以使用折线图展示，效果如下

在本次尝试中，小果使用了ggthemr这个配色主题包，上图使用的是flat主题，小云代码注释展示了可用的所有主题，大家可以换着尝试下

rm(list=ls());gc();


library(ggthemr)


library(ggplot2)


ggthemr('flat')#选择配色主题


#全部主题


#flat,flat dark,camouflage,chalk,copper,dust,earth,fresh,


#grape,grass,greyscale,light,lilac,pale,sea,sky,solarized


cro<-read.table("cv.txt",sep = "\t", head = TRUE)#读取文件


p<-ggplot(cro, aes(x =Number.of.clusters, y = CV,size=1)) + geom_line(size=1) +


geom_point(color='grey',size=1)+geom_hline(yintercept = 0.46941,col="red")


p+theme(axis.title.x =element_text(size=14), axis.title.y=element_text(size=14))+scale_x_continuous(limits=c(0,17))+theme(axis.text.x=element_text(size=15,angle=0,color="black"))+theme(axis.text.y =element_text(size=15,angle=0,color="black"))

至此结束

好了，以上就是小果的分享，是不是干货满满呢，小伙伴快去试试吧。

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scale_y_continuous

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