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单细胞+代谢最新套路!高分文章的最爱，请低调使用

scMetabolism包_单细胞层面定义代谢Hi，大家好，我是晨曦今天这期推文我们来学习一个新的R包：scMetabolism包我们用比较简短的话就可以概括这个R包的功能——scMetabolism包是一个在单细胞分辨率下定量代谢活动的R包研究代谢相关领域的小伙伴不要错过哦~那么我们开始吧期刊信息...

生信分析:散点图+箱式图+小提琴图三图叠加的分组差异分析图绘制

散点图+箱式图+小提琴图三图叠加的分组差异分析图绘制我们使用散点图+箱式图+小提琴图三种图形叠加在一起更全面详细地展示不同分组数据的分布情况。我编写了一个命令行下一键作图R语言脚本，不需要R语言基础的也可以用这个脚本直接进行进行作图箱式图箱式图是—种描述数据分布的统计图，是表述下边缘（Q1-1.5(...

这50张图教你做质量数据分析，干货分享

数据可视化分析的好处1在不歪曲事实的情况下传达正确和必要的信息。2设计简单。3美学支持信息而不是掩盖信息。4没有超载信息。关联图表用于可视化2个或更多变量之间的关系。也就是说，一个变量如何相对于另一个变化。1.散点图(Scatterplot)散点图是用于研究两个变量之间关系的经典的和基本的图表...

暴发调查系列三:发作时间和潜伏期分析

上一期我们应用R和Epicale程序包对数据集outbreak定义完病例以后，分析了暴露的时间，本期让我们来看一下发作时间。这里应用R和Epicale程序包对这些数据进行分析。首先，确认"onset"这个变量只用于病例。onset[!case]<-NA关于发作时间的计算方法与暴露时间的计算方...

R语言ggplot2数据可视化之qplot r语言ggplot2绘制趋势图

ggplot2是R语言中非常漂亮的可视化支持，下面通过dataset-airquality来对qplot函数的使用效果进行展示。airquality数据集airquality数据集是由154条6维数据组成的。library(ggplot2)导入ggplot2包qplot(Wind,Temp,...

涛哥文章系列(25):识别和比较基因列表的功能图谱

1导言近年来，基因芯片、RNA-Seq和质谱等高通量实验技术可以在系统水平上检测细胞分子。这类分析产生了大量的数据，需要给予生物学上的解释。一种常用的方法是通过在基因维度上进行聚类，根据基因的相似性对不同的基因进行分组。为了寻找基因之间共享的功能，一种常见的方法是结合生物学知识，如基因本体学(GO...

R数据分析:双因素方差分析与交互作用检验

Two-wayANOVAtestisusedtoevaluatesimultaneouslytheeffectoftwogroupingvariables(AandB)onaresponsevariable.双因素方差分析（Two-wayANOVAtest...

比较基因组:点图介绍与可视化 基因点位图怎么看

比较基因组：点图介绍与可视化动动发财的小手，点个赞吧！获得基因组后可以进行的主要比较分析之一是可视化与密切相关物种的同线性。基因组的许多特征可以通过良好的点图轻松突出显示。可以从这些点图中识别结构变化，例如倒置、删除、重复和插入。基因组点图（GenomeDotPlot）是一种用于比较两个或多个基...

描述性统计主要内容 描述性统计都有什么

描述性统计?将原始数据整理为简单有效的指标/图形/表格。统计指标—位置平均数(Mean)中位数(Me,Median)，将一列数据按照从小到大的顺序排列后，处于中间位置的那个数。四分位数(Quartile，Q1&Q3)众数(Mode)，一列数据中出现频率最高的那个数；一列数据中可能出现几个众数，...